Факультет фундаментальной подготовки образован решением Ученого совета СПбГУТ 28 марта 2013 года на основе Департамента фундаментальной подготовки, который включал в себя общеуниверситетские кафедры: Физики, Высшей математики (ВМ) и Теории электрических цепей (ТЭЦ).
При образовании факультета были присоединены кафедры Теоретических основ сигналов и радиосвязи (ТОСиР) и Электроники и схемотехники (ЭиС), которые также в значительной степени были ориентированы на обучение всех студентов университета.
Основателем и руководителем Департамента фундаментальной подготовки являлся Заслуженный деятель науки РФ, профессор Дмитриков Владимир Федорович, ныне почетный профессор СПбГУТ.
Первым деканом факультета, с момента его образования и до 2021 года, являлся Почетный работник высшего профессионального образования РФ, профессор Колгатин Сергей Николаевич.
В 2014 году кафедры ТОСиР и ТЭЦ объединились в кафедру Теории электрических цепей и связи (ТЭЦиС), в настоящее время – кафедра Теоретических основ телекоммуникаций (ТОТ), которую возглавил Почетный работник высшего профессионального образования РФ Шумаков Павел Петрович.
На факультете традиционно сильна научная работа. Здесь трудились в разное время и трудятся сегодня такие известные ученые, как Заслуженный деятель науки РФ, профессор Фурсей Георгий Николаевич; Заслуженный работник высшей школы РФ, профессор Савушкин Лев Николаевич, профессор Лившиц Александр Иосифович, профессор Филин Владимир Алексеевич, доктор Баскин Лев Маркович.
Факультет занимает заметное место в университете по количеству научных публикаций, по объему научных договоров, по числу докторов наук и подготовленных аспирантов.
Учеными и преподавателями факультета поддерживается и развивается ряд передовых научных направлений физики и электроники, таких как ключевые методы генерирования, усиления и преобразования электрической энергии с разработкой на этой основе современных высокоэффективных, стабилизированных источников и систем электропитания различных целевых назначений; водородная энергетика с перспективой создания эффективных и безопасных топливных элементов; взрывная электронная эмиссия с созданием компактных рентгеновских трубок; теоретические основы наноэлектроники, производство наноматериалов; теория атомного ядра.
Выполняя задачи по обеспечению базовой подготовки студентов младших курсов всего университета, факультет осуществляет собственную подготовку бакалавров и магистров по направлению «Электроника и наноэлектроника» – профиль «Промышленная электроника», а также магистров по направлению «Инфокоммуникационные технологии и системы связи» – профиль «Микроволновая техника. Объемные интегральные схемы».
Выпускаемые специалисты востребованы на многих электротехнических, радиотехнических и оборонных предприятиях Санкт-Петербурга, Северо-Запада и всей страны в целом. Лучшие выпускники-бакалавры получают возможность продолжить образование в магистратуре по направлениям, связанным с разработкой, исследованием и конструированием цифровых систем электропитания, гибридных интегральных схем и планарных излучателей СВЧ-диапазона, предназначенных для создания и совершенствования устройств и систем мобильной радиосвязи и систем радиолокации.