Здравствуйте!
Согласно п.47 "Порядка приема и обучения граждан Российской Федерации в военных учебных центрах при федеральных государственных образовательных организациях высшего образования" (http://mil.spbsut.ru/wp-content/uploads/2020/07/Приказ-МО-РФ-от-26.08.2020-№-400.pdf) в магистратуре можно обучаться только по программам подготовки офицеров запаса.
Военная подготовка по программам подготовки солдат запаса проводится только на базе бакалавриата или специалитета.