Отдел "Вычислительный центр" занимается решением двух основных задач: поддержка и обеспечение сетей передачи данных СПбГУТ и обеспечение сотрудников университета техническими средствами. Для этих целей внутри отдела созданы две группы: группа передачи данных и вычислительных ресурсов (ГПДиВР, руководитель — А.Ю. Шахов) и группа технического обеспечения инфокоммуникационных систем (ГМТО, руководитель — И.Г. Яхонтов). ГПДиВР занимается эксплуатацией и развитием локальной вычислительной сети университета, технической поддержкой порталов и сайтов, безопасностью передачи данных, телефонными сервисами и др. ГМТО занимается закупкой и распределением вычислительной техники и расходных материалов, заключает контракты с внешними поставщиками услуг.